扬州大学兽医学院成立于2003年12月，2004年1月经扬州大学工会批准成立扬州大学兽医学院工会，并于2004年3月成立第一届院工会委员会。目前全院有教职工122人，其中工会会员121人，入会率达到99.2%。

　　扬州大学兽医学院工会每年召开工会会员大会，每3年进行换届，按照《工会章程》民主选举产生工会委员及主席、副主席。 2017年3月成立的为院第5届工会委员会，原工会副主席、院党委委员、院办公室主任、院机关党支部书记高红明同志担任院工会主席。

　　第5届工会委员会成立后，成立了经费审查委员会和女职工委员会。经费审查委员会主任由院工会主席高红明同志兼任，副主任由院党委纪检员熊桂林同志兼任，委员由各系主任、实验中心主任兼任；女职工委员会主任由院工会女工委员王彦红同志兼任。

　　院工会设6个工会小组，预防兽医学系动物传染病学教研室及动物寄生虫学教研室为第一工会小组，预防兽医学系兽医微生物学教研室为第二工会小组，基础兽医学系为第三工会小组，临床兽医学系为第四工会小组，实验动物学系及实验中心为第五工会小组，院机关为第六工会小组。院工会委员兼任各工会小组小组长。