1. Introduction 

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2. Viral genetic elements and taxonomic classification

3. Common viral enteric pathogens of cattle and pigs

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4. Common viral respiratory pathogens of cattle and pigs (BRDC/PRDC)

5. Porcine high consequence viral pathogens

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6. Bovine high consequence viral pathogens

7. NGS-Isolates

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8. NGS-Microbiome/Virome

9. NGS-Transcriptomics

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10. Enrichment and bioinformatics techniques