本中心按学科组建了基础兽医学、预防兽医学、临床兽医学三个实验教学平台。目前，有实验教学用房10400平方米，学生实验室、实验准备室、仪器室、试剂室与办公用房等配套齐全。近3年，中心借助重点学科、中央与地方共建高校实验室等经费1000余万元为添置了一批先进仪器设备，加强了校内实习基地动物医院和实验动物中心的建设，使实验设施和实验环境达到国内先进水平，符合教育部有关要求。

扬州大学兽医学院所属的一批优势学科和科研团队为中心建设和良好运行提供了一流的软件环境。预防兽医学国家重点学科、兽医学一级学科博士学位点、兽医学江苏省重点一级学科点、江苏省产学研联合培养研究生示范基地、农业部畜禽传染病学重点开放实验室、江苏省动物预防医学重点实验室、江苏省人兽共患病学重点实验室、教育部新型疫苗工程研究中心、江苏省转基因动物制药工程研究中心、江苏省实验动物种子供应站等机构，为学生开展实验，特别是进行创新开放实验，提供了一流条件。校内的动物医院、实验动物中心、实验农牧场为学生实践训练，培养服务应用型人才提供了保障。